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报告指出，约12%的欧盟海域被海洋保护区所覆盖。欧盟海洋保护区可根据其划定依据分为以下三类：首先是依托《鸟类指令》和《栖息地指令》建立的Natura 2000保护区网络，约占欧盟海洋保护区总面积的43.1%；其次是基于区域海洋公约划定的保护区，分布在欧盟海域的四个区域海（波罗的海、东北大西洋、地中海和黑海），占保护区总面积的约9%；第三类是欧盟成员国根据国家法律设立的保护区，占保护区总面积的约6%。三类保护区存在交叉重叠的现象，重叠区域约占海洋保护区总面积的41.9%。